Als erste echte Fortsetzung des Klassikers aus dem Jahr 1988 lässt Bionic Commando den bionisch verstärkten Nathan "Rad" Spencer neu aufleben.
Zehn Jahre nach seinem heldenhaften Sieg über die Truppen des Imperiums sorgt eine Verschwörung dafür, dass er gefangen genommen und zum Tode verurteilt wird. Am Tag der Urteilsvollstreckung lassen Terroristen in Ascension City eine experimentelle Waffe explodieren, die ein Erdbeben auslöst, die gesamte Stadt in Schutt und Asche legt und das Leben aller Einwohner auslöscht.
Nachdem sich die Stadt in der Kontrolle einer Armee von Terroristen befindet, deren Absichten im Dunkeln liegen, bleibt der TASC nur eine einzige Chance: ein Bionic Commando.
Bionic Commando überträgt das Schwingen und Schießen aus der Originalversion in eine atemberaubende 3-D-Umgebung voller Hochhäuser, Straßenbrücken und Schwebebahnen, tiefer Schluchten und steiler Klippen, die es durch Schwingen, Klettern, Balancieren und Wandlaufen zu überwinden gilt.
Bionic Commando enthält einen Mehrspielermodus, in dem man sich mit Drahtseilen von Plattform zu Plattform schwingen kann, während man die Gegner verfolgt. Die Spieler müssen dabei die Fähigkeiten nutzen, die sie als Einzelspieler verfeinert haben, um die wahre Macht eines Bionic Commando zu demonstrieren, denn das Spiel enthält eine Funktion zur Gruppenzusammenstellung und ausführliche statistische Analysen.
